به نام علم، بپیچانش!

13

Foldit
یک بازی کامپیوتری انقلابی است که به شما اجازه می‌دهد در
پژوهش‌های علمی مهم مشارکت کنید.

 fold it.gif

برای اینکه با مفهوم این بازی و هدف طراحان آن پی ببرید، باید
کمی در مورد پروتئین‌ها و اهمیت تاخوردگی یا پیچ خوردن پروتئین‌ها توضیح دهم:

بدن انسان از تریلیون‌ها سلول تشکیل شده است: سلول‌های عضلانی،
مغزی، عصبی، خونی و … اما چیزی که واقعا این سلول‌ها را در انجام دادن کارهایشان
توانا می‌کند، چیزی نیست جز پروتئین‌. این پروتئین‌ها هستند که غذاها را تجزیه
می‌کنند، باعث انتقال پیام‌های عصبی می‌شوند و مواد غذایی را در خون منتقل می‌کنند.

هر پروتئین از زنجیره درازی از اسیدهای آمینه درست شده است.
اسیدهای آمینه، پروتئین‌های کوچکی هستند که از کربن، اکسیژن، گوگرد و نیتروژن درست
شده‌اند. در مجموع ۲۰ نوع اسید آمینه مختلف وجود دارد که خواص شیمیایی مختلفی
دارند.

اما زنجیره دراز اسیدهای آمینه، به صورت یک زنجیر ساده باقی
نمی‌ماند و تاخوردگی زیادی پیدا می‌کند تا پایدارترین شکل ممکنه را پیدا
کند. هر پروتئین خاص در موقعیت و شکل خاصی پایدارترین شکل خود را پیدا می‌کند.

شکل پروتئین‌ها بسیار مهم است، مثلا پروتئینی که گلوکز را
می‌شکند تا از این طریق انرژی سلول‌ها را تأمین کند، باید طوری شکل بگیرد که به
راحتی قادر به شناسایی گلوکز باشد.

با توجه به این مقدمات می‌توان گفت که شناخت ساختمان
پروتئین‌ها، کلیدی است برای فهم چگونگی کارکرد آنها.
وقتی ساختمان یک پروئتئین
مشخص شد، می‌توان داروها را چنان طراحی کرد که پروتئین‌های خاصی را هدف بگیرند.

حتی یک پروتئین ساده و کوچک می‌تواند به شکل‌ها بسیار متفاوتی
تا بخورد و شکل‌های متفاوتی پیدا کند. تنوع بسیار زیادی که هر پروتئین به صورت
بالقوه برای پیچ و تاب خوردن و شکل گرفتن دارد، کار پژوهشگران را بسیار دشوار
می‌کند چرا که آنها را وادار می‌کند با صرف پول و انرژی زیاد و بهره‌گیری از
کامپیوترها، حالات ممکن تا خوردن پروتئین‌ها را شناسایی کنند.

 

محاسبه اشکل مختلف تاخوردگی یک پروتئین با استفاده از کامپیوتر
و الگوریتم‌های کامپیوترهای، ممکن است در نگاه اول بهترین روش به نظر برسد. اما با
همه تلاش برنامه‌نویس‌ها، این برنامه‌ها آنچنان که باید و شاید هوشمند نشده‌اند.
این برنامه‌ها برای پیشبینی شکل یک پروتئین، سیستم‌های کامپیوتری را مجبور می‌کنند
که همه حالات ممکنه را در نظر بگیرند و میلیاردها محاسبه انجام بدهند. حتی به خاطر
نیازی که دانشمندان و زیست‌شناسان به ابرریانه‌ها برای این محاسبه‌ها داشتند، آنها دست
کمک به سوی رایانه‌های شخصی داوطلبانی از سراسر جهان هم دراز کرده‌اند و از سه سال پیش
از نیروی محاسباتی پردازشگرهای رایانه های شخصی هم استفاده می‌کنند. در حال حاضر ۲۰۰
هزار داوطلب از سراسر جهان حاضر شده‌اند، توان پردازشی رایانه‌های خود را در زمانی
که کاری با آنها ندارند، در اختیار دانشمندان قرار بدهند.

اما نه ابررایانه‌ها و نه پردازشگرهای کامپیوترهای خانگی
نتوانستند کمک زیادی به محققان کنند. آنها کم کم به این نتیجه رسیدند که چیزی که
نیازمند آن هستند، نیروی پردازش انسانی است و نه الگوریتم های کامپیوتری!

بازی Foldit، دقیقا به همین منظور طراحی
شده است. این بازی با مشارکت دانشمندان دانشگاه واشنگتن و انستیتوی پزشکی هاوارد
هیوز، طراحی شده است. بعد از ثبت نام در سایت و دانلود برنامه ۵۰ مگابایتی، برنامه
ابتدا کاربران را در قالب یک بازی با مفهوم تاخوردن پروتئین‌ها آشنا می‌کند،
کاربران هیچ نیازی به داشتن دانش بیوشیمی و یا مفهوم حقیقی تاخوردگی پروتئین‌ها
ندارند، برنامه آنها را وادار به بازی می‌کند و در حین بازی آنها با تا کردن
پروتئین‌ها امتیازهای بیشتری کسب می‌کنند و به طور همزمان با استفاده از توان
پردازشی خود به دانشمندان کمک می‌کنند.

شناخت ساختمان پروتئین‌ها کلید درمان بیماری هایی مانند ایدز،
سرطان و آلزایمر است.

ممکن است دانلود یک برنامه ۵۰ مگابایتی برای کاربران ایرانی
ممکن نباشد و شاید آنها علاقه‌ای به این گونه معماهای هندسی و توپولوژی نداشته
باشند، اما چیزی که برای من بسیار جالب بود، فکر بکر دانشمندان برای استفاده از
توان پردازش انسانی، در قالب یک بازی و به صورت اجتماعی برای تحقیقات علمی بود.

   
13 نظرات
  1. magid می گوید

    خیلی جالب انگیزناک است

  2. صادق می گوید

    بالاخره یه بازی به درد بخور هم دیدیم!

  3. مینامهرپویا می گوید

    سلام و روز بخیر!
    مطالب پرباری داخل وبلاگتون دارید و کاملا مشهود است که جمع آوری پر زحمتی داشته اید …بهر حال خسته نباشید.

    خواستم بهتون پیشنهاد بدم از

    سرویسهای

    http://abctools.ir/Weather/Gadget.aspx و
    http://abctools.ir/News/Gadget.aspx و
    http://abctools.ir/Dic/Gadget.aspx و
    http://abctools.ir/Owghat/Gadget.aspx

    که مربوط به نمایش آب و هوا ؛ آخرین اخبار با موضوع و کلمات کلیدی (که در مورد شما اخبار پزشکی،آزمایشاهی و عناوین تخصصی بسیار مفید خواهد بود) ؛ لغت نامه و اوقات شرعیه استفاده کنی؛
    این سایت کار من و دوستامه و امیدوارم توی وبلاگا استفاده ازش نهادینه !!!! بشه

    راستی ۲ تا از نمونه های اجرا شدش هم هست

    http://sefr.ir
    http://niniboos.blogfa.com

    اگر راهنمایی خواستی امر کن.

  4. سینا می گوید

    برنامه اش از کجا دانلود میشه. امتحانی بکنیم. با بازی گوگل برای لیبل زنی تصاویرش که تقریباً با همین روش بود، مدتها سرگرم شدیم. اینهم امتحانی بکنیم

  5. yassin می گوید

    یکی از مسائل مهمی که الان در زمینه‌ی وب ۲.۰ مطرح می‌شه همین ایده‌ی عقل جمعی (یا Collective Intelligence) هستش. مثل همون استفاده از سایت رنکینگ توسط موتور جستجوی گوگل که باعث شده موتورهای جستجو رو از تحلیل‌های پیچیده که قبلا روی سایت‌ها انجام می‌دادن بی‌نیاز بکنه و همین طور استفاده‌ی گوگل مپس از اطلاعاتی که کاربرها در اختیارش قرار می‌دن یا سیستم‌های تگ گذاری که توسط کاربرها برای طبقه‌بندی استفاده می‌شه و خیلیای دیگه… و علاوه بر این‌ها به نظر می‌رسه که حل مسایل پیچیده بر مبنای تئوری‌های محظ چندان هم دقیق نیست چون همواره عوامل متعددی وجود داره که قابل پیش‌بینی نیست و اینجاست که استفاده از یک بانک اطلاعاتی عظیم که توسط مجموعه‌ی زیادی از انسان‌ها تهیه شده کار رو خیلی راحت‌تر می‌کنه چیزی که تا جند سال پیش دسترسی بهش غیر ممکن بود… مطالب وبلاگ شما همیشه پربار و خیلی چیزها می‌شه ازش یاد گرفت، موفق باشی.

  6. آزاده نيلي می گوید

    سلام آقای مجیدی
    خیلی وقت است پست های زیبای شما را می خوانم ولی این یکی چیزی را در ذهنم زنده کرد.
    خاطره کلاس اتوماسیون و کارخانه های یخ زده فردا پر از ربات های کوچک و بزرگ
    بی زمزمه کارگران، بی واحد منابع انسانی، بی شوق لحظات دریافت حقوق و عیدی و پاداش
    و این پست شما که می گفت انسانها هنوز به انسانها نیاز دارند.

  7. مهدی می گوید

    این کارایی اگر به آن دقت شود می‌تواند در آموزش الکترونیک کاربرد بالایی داشته باشد، منتها متاسفانه در کشور ما آموزش الکترونیک تنها سایت دارشدن آن هم به صورت ناقص معنا یافته است.

  8. رضا می گوید

    جایی خواندم اگر تمام منابع کره زمین تمام شود چون ما خلاقیت را داریم جای نگرانی نیست .
    جالبه که اینها که این چیز ها را بوجود می آورند هیچ ادعایی هم ندراند.

  9. Saeeid می گوید

    ‫ایده ی جالبی است ، سعی میکنم اونو امتحان کنم.

  10. sahand می گوید

    مرسی…
    واقعا جالب و مفید بودن

  11. hooman می گوید

    agha merci. vaghean lezat bordam va estefade kardam

  12. امین می گوید

    سلام.احوال شما؟

  13. امین می گوید

    نرم افزار ‏NOKIA XPRESS‏ رو لطفا به آدرس ‏Aminkiaalvandi@yahoo.com‏ بفرستین،واسه گوشی ‏NOKIA X2‏ باسپاس.امین از شمال

پاسخ به سینا
لغو پاسخ

آدرس ایمیل شما منتشر نخواهد شد.