پایگاه داده باورنکردنی از تقریباً تمام پروتئین‌هایی که دانشمندان شناخته‌اند

0

سال گذشته، DeepMind Alphabet یک پایگاه داده منبع باز از ساختار‌های سه بعدی صد‌ها هزار پروتئین، از جمله تمام ۲۰ هزار پروتئین شناخته شده در بدن انسان، منتشر کرد. اکنون، این پایگاه داده اطلاعات ۲۰۰ میلیون پروتئین را دارد که تقریباً تمام پروتئین‌های شناخته شده از نظر علمی را شامل می‌شود.

پروتئین‌ها محور سلول‌های زنده هستند که تعداد بی‌شماری از فرآیند‌های زیستی را انجام می‌دهند. آن‌ها از زنجیره‌ای از اسید‌های آمینه تشکیل شده‌اند که به شکل‌های سه‌بعدی پیچیده تا می‌شوند تا عملکرد خود را دیکته کنند. ترسیم ساختار پروتئین‌ها برای درک اینکه چه کاری انجام می‌دهند، چگونه کار می‌کنند و چگونه ممکن است روندها اشتباه پیش برود، مهم است و کلیدی برای تحقیق در مورد همه چیز از دارو‌ها و درمان‌های جدید تا بهبود محصولات کشاورزی و حفاظت از حیوانات است.

اما محاسبه ساختار دقیق یک پروتئین بر اساس اسید‌های آمینه تشکیل دهنده آن دشوار است. پی بردن به این موضوع معمولاً به مقدار زیادی قدرت پردازشی و صرف وقت زیاد از سوی نیروهای انسانی نیاز دارد و این وضعیت به «مشکل تاخوردگی پروتئین» protein folding problem معروف شده است. به این ترتیب، پیشرفت در طول دهه‌ها نسبتاً کند بوده است.

اما آلفابت Alphabet با هوش مصنوعی DeepMind مدتی است که روی این مشکل متمرکز شده است. این سیستم که در ابتدا بر روی ۱۰۰ هزار ساختار پروتئینی شناخته شده آموزش دیده بود، توانایی پیش‌بینی ساختار میلیون‌ها پروتئین دیگر را در خود توسعه داد. جالب است که زمان لازم برای تعیین ساختار هر پرپتئین به‌جای ماه‌ها یا سال‌ها، با این روش تنها چند دقیقه یا ثانیه زمان می‌برد.

در ژوئیه ۲۰۲۱ اولین پایگاه داده ساختار پروتئین آلفا فولد برای دانشمندان در دسترس عموم قرار گرفت. در ابتدا حاوی بیش از ۳۵۰ هزار ساختار پروتئینی بود که حدود ۹۸.۵  درصد از پروتئین‌های انسانی و همچنین پروتئین‌های موجود در مگس‌های میوه، موش، مخمر و باکتری E. coli را شامل می‌شد. این پایگاه داده بعد‌ها به حدود یک میلیون ساختار پروتئینی از ۱۰ هزار گونه جانوری، گیاهی، باکتریایی، قارچی و سایر موجودات گسترش یافت.  یک سال پس از آن، بیش از ۵۰۰ هزار دانشمند از سراسر جهان برای کمک به تحقیقات خود به پایگاه داده دسترسی پیدا کرده‌اند.

اکنون، DeepMind یک به روز‌رسانی عظیم جدید برای پایگاه داده منتشر کرده که شامل حدود ۲۱۴ میلیون ساختار از یک میلیون گونه است. این تقریباً تمام پروتئین‌های شناخته شده از نظر علمی است و می‌تواند برای تحقیق در مورد درمان بیماری‌ها، واکسن‌ها، مقاومت آنتی‌بیوتیکی و حتی آلودگی پلاستیکی، به محققان کمک کند.

کل پایگاه داده ساختار‌های پروتئین، متشکل از بیش از ۲۵ ترابایت داده، را می‌توان از مجموعه داده‌های عمومی Google Cloud دانلود کرد.

منبع: DeepMind


اگر خواننده جدید سایت «یک پزشک»  هستید!
شما در حال خواندن سایت یک پزشک (یک پزشک دات کام) به نشانی اینترنتی www.1pezeshk.com هستید. سایتی با 18 سال سابقه که برخلاف اسمش سرشار از مطالب متنوع است!
ما را رها نکنید. بسیار ممنون می‌شویم اگر:
- سایت یک پزشک رو در مرورگر خود بوک‌مارک کنید.
-مشترک فید یا RSS یک پزشک شوید.
- شبکه‌های اجتماعی ما را دنبال کنید: صفحه تلگرام - صفحه اینستاگرام ما
- برای سفارش تبلیغات ایمیل alirezamajidi در جی میل یا تلگرام تماس بگیرید.
و دیگر مطالب ما را بخوانید. مثلا:

عکس‌های بسیار جالبی از روز‌های اولیه هوانوردی، دهه‌های 1890-1930

در اواخر قرن 19 و اوایل قرن 20، جهان شاهد تغییر ژرفی در فناوری شد. رویاپردازانی مانند برادران رایت، اتو لیلینتال و آلبرتو سانتوس-دومونت که با میل سیری ناپذیر برای تسخیر قلمرو‌های ناشناخته پرواز می‌کوشیدند، با جسارت و عزم تزلزل ناپذیر داستان…

اولم، یکی از عجیب‌ترین جانداران روی زمین – شبیه جنین نارس یا موجودات سری فیلم‌های بیگانگان

جانداری به نام Proteus anguinus که همچنین به عنوان اولم olm شناخته می‌شود، گونه‌ای سمندر است که بومی آب‌های زیرزمینی آلپ در جنوب شرقی اروپا است. این جاندار از معدود مهره‌داران غارنشین است و به دلیل شکل سر و دست‌ها  رنگ سفید مایل به صورتی و…

چرا بسیاری از ساختمان‌های تاریخی در بریتانیا دارای پنجره‌های آجرکوبی شده هستند؟

زمانی در بریتانیای کبیر داشتن پنجره در خانه‌ها و ساختمان‌ها بسیار گران از آب درمی‌آمد! چرا؟!چون در سال ۱۶۹۶ با وضع مالیات بر پنجره که بسیار در جامعه منفور بود، وضعیت تغییر کرد. در این زمان مالیات بر صاحبان املاک را بر اساس تعداد…

عملیات گانرساید: حمله نروژ به تاسیسات آب سنگین نازی‌ها که آنها را از بمب اتمی محروم کرد

سرهنگ ارتش سلطنتی نروژ، لیف ترونستاد، پس از تحویل کپسول‌های انتحاری، به سربازانش اطلاع داد: «نمی‌توانم به شما بگویم که چرا این مأموریت اینقدر مهم است، اما اگر موفق شوید، برای صد سال در خاطره نروژ زنده خواهد ماند.»با این حال، این…

روش‌های بد نشستن روی صندلی و شیوه نشستن سالم روی صندلی در محیط کار

در موقعیت‌های مختلف یا در هنگام خستگی، روش‌های مختلفی برای نشستن روی صندلی از سوی ما استفاده می‌شود که برای بدن مفید نیستند. برخی از این موارد عبارتند از:خم شدن روی صندلی: وقتی روی صندلی خمیده می‌شوید، ستون فقرات شما به درستی حمایت…

عکس‌های جالبی از ساخت و سازها و اقدامات معماری نافرجام

مجموعه زیر به ظاهر مفرح یا حتی خنده‌دار است اما هر یک گویای نبود نقشه، مغز طراح یا ذهنی است که به صورت ساده کار را در ذهن شبیه‌‌سازی کند.مشابه این جمله مشهور را که عیب برنامه، در حین انجام آن بیرون می‌آید را در عمرمان زیاد شنیده‌ایم و…
آگهی متنی در همه صفحات
دکتر فارمو / قیمت گوسفند زنده / موتور فن کویل / سپتیک تانک /کپسول پرگابالین / لیزر زگیل تناسلی /بهترین کلینیک کاشت مو مشهد /داروخانه آنلاین / بهترین سریال های ۲۰۲۴ / خرید دستگاه تصفیه آب / تجهیزات و وسایل دندانپزشکی /ثبت برند /خدمات پرداخت ارزی نوین پرداخت / کلینیک زیبایی دکتر محمد خادمی /جراح تیروئید / پزشکا /تعمیر فن کویل / سریال ایرانی کول دانلود / مجتمع فنی تهران / دانلود فیلم دوبله فارسی /خرید دوچرخه برقی /موتور فن کویل / شیشه اتومبیل / نرم افزار حسابداری / خرید سیلوسایبین / هوش مصنوعی / مقاله بازار / شیشه اتومبیل / قیمت ایمپلنت دندان با بیمه /بهترین دکتر لیپوماتیک در تهران /بهترین جراح بینی در تهران /کاشت مو / درمان طب / تجهیزات پزشکی /داروخانه اینترنتی آرتان /اشتراك دايت /فروشگاه لوازم بهداشتی /داروخانه تینا /لیفت صورت در تهران /فروش‌ دوربین مداربسته هایک ویژن /سرور مجازی ایران /مرکز خدمات پزشکی و پرستاری در منزل درمان نو /سایت نوید /پزشک زنان سعادت آباد /کلاه کاسکت / لمینت متحرک دندان /فروشگاه اینترنتی زنبیل /ساعت تبلیغاتی /تجهیزات پزشکی /چاپ لیوان /بهترین سریال های ایرانی /کاشت مو /قیمت ساک پارچه ای /دانلود نرم افزار /

ارسال یک پاسخ

آدرس ایمیل شما منتشر نخواهد شد.